負責藥品（含特殊管理藥品）生產、醫療機構制劑配制監督管理；監督實施藥品生產、醫療機構制劑配制質量管理規范；參與實施國家基本藥物制度相關工作。負責藥品批發、零售連鎖總部、互聯網藥品信息服務、疫苗委托儲存配送監督管理；監督實施藥品經營和使用質量管理規范；組織實施藥品分類管理制度；依職責組織指導藥品零售和使用環節監督管理；依法承擔特殊管理藥品經營和使用環節監督管理。監督實施醫療器械生產質量管理規范；指導實施醫療器械經營和使用質量管理規范；組織實施醫療器械分級分類管理制度；承擔醫療器械生產環節和網絡銷售第三方平臺監督檢查。監督實施化妝品標準、分類規則、技術指導原則；負責化妝品生產環節監督檢查；組織實施化妝品監督檢查；指導化妝品經營和使用環節監督管理；落實國家有關鼓勵化妝品新技術新產品的管理與服務政策。指導藥品、醫療器械和化妝品稽查執法；承擔行政執法與刑事司法銜接管理和信用體系建設工作；組織落實國家和自治區藥品、醫療器械、化妝品質量抽檢任務，組織制定并實施地區抽檢計劃，定期發布質量公告；組織開展藥品、醫療器械、化妝品的核查處置及召回管理。